Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CHD3Q12873 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CHD3Q12873 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CHD3Q12873 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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CHD3Q12873 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CHD3Q12873 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHD3Q12873 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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