Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms