Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLEQ07864 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms