Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms