Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms