Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms