Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms