Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms