Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms