Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms