Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms