Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HTD2P86397 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HTD2P86397 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms