Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMF1P82094 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms