Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM15P57071 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM15P57071 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms