Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPD52P55327 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TPD52P55327 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms