Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1BP53609 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGGT1BP53609 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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