Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1DP48730 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms