Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms