Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPCAL1P37235 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms