Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA3P35244 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA3P35244 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms