Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALDH4A1P30038 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms