Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ITGA3P26006 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ITGA3P26006 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ITGA3P26006 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ITGA3P26006 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ITGA3P26006 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ITGA3P26006 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ITGA3P26006 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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