Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USF1P22415 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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