Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTPRAP18433 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRAP18433 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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