Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DESP17661 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DESP17661 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DESP17661 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DESP17661 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DESP17661 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DESP17661 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DESP17661 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DESP17661 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DESP17661 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DESP17661 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms