Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NME1P15531 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NME1P15531 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NME1P15531 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms