Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFTRP13569 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFTRP13569 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFTRP13569 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFTRP13569 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFTRP13569 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms