Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TPRP12270 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TPRP12270 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TPRP12270 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TPRP12270 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TPRP12270 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TPRP12270 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TPRP12270 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TPRP12270 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TPRP12270 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms