Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODC1P11926 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms