Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOP08100 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOP08100 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms