Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TRIM16O95361 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM16O95361 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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