Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDIL3O43854 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms