Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGTAO43765 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGTAO43765 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms