Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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