Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms