Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMX2-CTNND1H3BSU7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms