Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms