Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf172C9J069 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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