Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-2B6SEH9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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