Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms