Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms