Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3CA6NKF2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms