Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms