Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms