Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC108704.1-201ENST00000611714 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AL096700.1-201ENST00000358001 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MTHFD2P6-201ENST00000506170 1022 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC090607.3-201ENST00000559954 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSUH2Q9Y2M2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms