Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms