Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CGGBP1Q9UFW8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CGGBP1Q9UFW8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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