Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RNF7Q9UBF6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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RNF7Q9UBF6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF7Q9UBF6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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