Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms