Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXC10Q9NYD6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms